Nouvelle variante de coronavirus: Que savons-nous?

La propagation rapide d’une nouvelle variante du coronavirus a été imputée à l’introduction de règles strictes de mélange de niveau quatre pour des millions de personnes, à des restrictions plus strictes sur le mélange à Noël en Angleterre, en Écosse et au Pays de Galles, et dans d’autres pays interdisant de voyager au Royaume-Uni.

Alors, comment est-il passé d’inexistant à la forme la plus courante de virus dans certaines régions d’Angleterre en quelques mois?

Les conseillers du gouvernement sur les nouvelles infections ont une confiance “modérée” qu’il est plus capable de transmettre que d’autres variantes.

Tout le travail est à un stade précoce, contient d’énormes incertitudes et une longue liste de questions sans réponse.

Les virus mutent tout le temps et il est essentiel de rester concentré sur le fait que le comportement du virus change.

Pourquoi cette variante est-elle préoccupante?

Trois choses se rejoignent, ce qui signifie qu’elle attire l’attention: Il remplace rapidement les autres versions du virus Il a des mutations qui affectent une partie du virus susceptible d’être importante Il a déjà été démontré en laboratoire que certaines de ces mutations augmentaient la capacité du virus à infecter les cellules Tous ces éléments sont réunis pour construire un dossier pour un virus qui peut se propager plus facilement. Cependant, nous n’avons pas de certitude absolue.

De nouvelles souches peuvent devenir plus courantes simplement en étant au bon endroit au bon moment – comme Londres, qui n’avait que des restrictions de niveau deux jusqu’à récemment.

la justification des restrictions de niveau quatre est en partie de réduire la propagation de la variante. “Des expériences en laboratoire sont nécessaires, mais voulez-vous attendre des semaines ou des mois [pour voir les résultats et prendre des mesures pour limiter la propagation]? Probablement pas dans ces circonstances”, a déclaré le professeur Nick Loman, du Covid-19 Genomics UK Consortium.

Il a été détecté pour la première fois en septembre. En novembre, environ un quart des cas à Londres étaient la nouvelle variante. Cela a atteint près des deux tiers des cas à la mi-décembre.

Vous pouvez voir comment la variante est arrivée à dominer les résultats des tests dans certains centres tels que le Milton Keynes Lighthouse Laboratory.

Les mathématiciens ont utilisé les nombres sur la répartition des différentes variantes pour tenter de calculer la valeur de l’avantage que celle-ci pourrait avoir. Mais il est difficile de distinguer ce qui est dû au comportement des gens et ce qui est dû au virus.

Le chiffre mentionné par le Premier ministre Boris Johnson était que la variante pourrait être jusqu’à 70% plus transmissible. Il a dit que cela pourrait augmenter le nombre R – qui indique si une épidémie augmente ou diminue – de 0,4.

Ce nombre de 70% est apparu vendredi dans une présentation du Dr Erik Volz, de l’Imperial College de Londres. Au cours de la conférence, il a déclaré: “Il est vraiment trop tôt pour le dire … mais d’après ce que nous voyons jusqu’à présent, il se développe très rapidement, il croît plus vite que [une variante précédente] n’a jamais grandi, mais il est important de garder un œil sur ce.

” Il n’y a pas de chiffre précis indiquant à quel point la variante peut être plus infectieuse. Les scientifiques, dont les travaux ne sont pas encore publics, m’ont indiqué des chiffres à la fois bien supérieurs et bien inférieurs à 70%.

Mais il reste des questions quant à savoir s’il est plus contagieux du tout. “La quantité de preuves dans le domaine public est terriblement insuffisante pour tirer des opinions fortes ou fermes sur la question de savoir si le virus a vraiment augmenté la transmission”, a déclaré le professeur Jonathan Ball, virologue à l’Université de Nottingham.

Jusqu’où s’est-il propagé?

On pense que la variante est apparue chez un patient au Royaume-Uni ou a été importée d’un pays avec une capacité inférieure à surveiller les mutations du coronavirus.

La variante peut être trouvée dans tout le Royaume-Uni, à l’exception de l’Irlande du Nord, mais elle est fortement concentrée à Londres, dans le sud-est et dans l’est de l’Angleterre.

Les cas ailleurs dans le pays ne semblent pas avoir décollé. Les données de Nextstrain, qui surveille les codes génétiques des échantillons viraux dans le monde, suggèrent que des cas au Danemark et en Australie proviennent du Royaume-Uni.

Les Pays-Bas ont également signalé des cas.

Une variante similaire qui a émergé en Afrique du Sud partage certaines des mêmes mutations, mais semble être sans rapport avec celle-ci.

Cela s’est-il déjà produit?

Oui. Le virus qui a été détecté pour la première fois à Wuhan, en Chine, n’est pas le même que celui que vous trouverez dans la plupart des coins du monde.

La mutation D614G est apparue en Europe en février et est devenue la forme dominante mondiale du virus. Un autre, appelé A222V, s’est répandu dans toute l’Europe et était lié aux vacances d’été des gens en Espagne.

Que savons-nous des nouvelles mutations?

Une première analyse de la nouvelle variante a été publiée et identifie 17 modifications potentiellement importantes. Il y a eu des changements dans la protéine de pointe – c’est la clé que le virus utilise pour ouvrir la porte aux cellules de notre corps. Une mutation appelée N501Y modifie la partie la plus importante du pic, connue sous le nom de «domaine de liaison au récepteur».

C’est là que la pointe entre en premier contact avec la surface des cellules de notre corps. Tout changement qui facilite l’entrée du virus à l’intérieur est susceptible de lui donner un avantage.

“Cela ressemble et sent comme une adaptation importante”, a déclaré le professeur Loman. L’autre mutation – une délétion H69 / V70, dans laquelle une petite partie de la pointe est retirée – est apparue plusieurs fois auparavant, y compris chez le vison infecté.

Les travaux du professeur Ravi Gupta de l’Université de Cambridge ont suggéré que cette mutation multiplie par deux l’infectivité dans les expériences de laboratoire.

Des études menées par le même groupe suggèrent que la suppression rend les anticorps du sang des survivants moins efficaces pour attaquer le virus. Le professeur Gupta m’a dit: “Il augmente rapidement, c’est ce qui inquiète le gouvernement, nous sommes inquiets, la plupart des scientifiques sont inquiets.”

D’où vient-il?

La variante est exceptionnellement fortement mutée.

L’explication la plus probable est que la variante est apparue chez un patient dont le système immunitaire est affaibli et incapable de vaincre le virus.

Au lieu de cela, leur corps est devenu un terrain fertile pour la mutation du virus.

Cela rend-il l’infection plus mortelle?

Il n’y a aucune preuve pour suggérer que c’est le cas, même si cela devra être surveillé. Cependant, une simple augmentation de la transmission suffirait à causer des problèmes aux hôpitaux.

Si la nouvelle variante signifie que plus de personnes sont infectées plus rapidement, cela conduirait à son tour à un plus grand nombre de personnes nécessitant un traitement hospitalier.

Les vaccins fonctionneront-ils contre la nouvelle variante?

Presque certainement oui, ou du moins pour le moment. Les trois principaux vaccins développent une réponse immunitaire contre le pic existant, c’est pourquoi la question se pose.

Les vaccins entraînent le système immunitaire à attaquer plusieurs parties différentes du virus, donc même si une partie du pic a muté, les vaccins devraient toujours fonctionner.

“Mais si nous la laissons ajouter d’autres mutations, vous commencez à vous inquiéter”, a déclaré le professeur Gupta. “Ce virus est potentiellement sur une voie pour échapper au vaccin, il a franchi les deux premières étapes dans ce sens.”

La fuite du vaccin se produit lorsque le virus change de sorte qu’il évite le plein effet du vaccin et continue d’infecter les gens. C’est peut-être l’élément le plus inquiétant de ce qui se passe avec le virus.

Cette variante n’est que la dernière à montrer que le virus continue de s’adapter car il infecte de plus en plus d’entre nous. Une présentation du professeur David Robertson, de l’Université de Glasgow, vendredi, a conclu: “Le virus sera probablement capable de générer des mutants d’échappement du vaccin.”

Cela nous placerait dans une situation similaire à celle de la grippe, où les vaccins doivent être régulièrement mis à jour. Heureusement, les vaccins dont nous disposons sont très faciles à modifier.

James Gallagher Correspondant de la BBC (santé et science)

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